Compass Software for Simple Western

Compass for SWは、Simple Western機器専用の制御・データ解析アプリケーションです。直感的なインターフェースと強力なツールにより、アッセイの設定からタンパク質の定量およびアノテーションの自動化まで、データ解析を効率化します。

  • 各タンパク質やアイソフォームの定量解析は自動です。
  • 結果はレーンビュー、グラフビュー、またはデジタルキャピラリー画像として表示できます。
  • データおよびレポートは、ボタンひとつで簡単にエクスポートできます。
  • Compass Authorization Server を利用すると、21 CFR Part 11準拠もサポートされます。

Compass for SWユーザーガイドをダウンロード

Compass Icon
Compass for Simple Western Version 7

Compass for SW Version 7.1

Leo・Jess・Abby向け 

Compass for Simple Western Version 6

Compass for SW Version 6.3

Wes向け 

Compass for Simple Western Version 5

Compass for SW Version 7.1の新機能

Version 7.1は、Wes、Peggy Sue、Sally Sue、NanoPro 1000とは互換性がありません。

標準曲線作成ツール

  • 標準曲線を作成し、未知検体の濃度を決定できます。
  • Version 7.1では、線形、4PL、対数-対数のカーブフィットをサポートしています。

サンプル・グループ分析

  • サンプル名や属性など 、アッセイレイアウトで定義した属性でサンプルをグループ化できます。
  • サンプルのグループ化により、レプリカの比較や、変動データを迅速かつ簡単に得られます。

Leoのアッセイセットアップと解析

  • Compass for SW 7.1では、25~100本のキャピラリーと1~4個のカートリッジを使用して、Leo用のアッセイをセットアップできます。
  • 各カートリッジの基準用コントロールでカートリッジ間のばらつきを補正し、1つのカートリッジから得られたデータと別のカートリッジから得られたデータを定量的に比較できます。
R&D Systems Simple Western Instrument Leo

Compass for SW Version 6.3以降の機能

Version 6.3は、Leo、Peggy Sue、Sally Sue、NanoPro 1000とは互換性がありません。

レーンの注釈

  • 注釈ツールを用いて、出版物やプレゼンテーション用にレーンビュー図を作成できます。
  • レーンの並び順や表示される分子量を調整したり、複数のチャンネルビューを重ねて表示したりできます。レーンラベルを整理してまとめたり、位置を変えたり、ラベルグループを追加してサンプル処理条件やタイムコース情報の追加なども可能です。

ピークの測定範囲の調整

  • より正確な定量結果を得るために、グラフビューでピークの開始と終了の境界を手動で調整できます。

総タンパク質ノーマライゼーションの調整

  • 開始位置と終了位置のピクセルを指定してベースラインを手動で調整し、より柔軟にデータをノーマライズできます。
Multiplexing with Jess Compass Software Lane View

Compass for SW Version 5.0.1のみの機能

Compass for SW 5.0.1はLeoまたはAbbyと互換性がありません。

チャージベースのタンパク質解析

  • タンパク質データはエレクトロフェログラムとしてグラフ表示でき、複数のサンプルのデータを重ねて表示もできます。 名前やpIでピークは自動的に定義されます。
  • ピーク上にカーソルを置くと、そのタンパク質固有の情報を表示できます。 検出されたアイソフォームの定量分布は、エクスポート機能により表で出力できます。
Simple Western Compass Charge Assay Graph View

Compass for SW Versions 5.0.1以降のすべての機能

ハイダイナミックレンジ(HDR)検出プロファイル 本機能は画像を撮るたびにキャピラリーの発光基質をアッセイプレートから入れ替え、ハイダイナミックレンジのマルチ画像分析のアルゴリズムで、ダイナミックレンジを広げます。

レポート レポートをpdfファイルとしてエクスポートできます。 プレートレイアウト、サンプルごとのピークデータ、画像などをリストから選択できます。

多重露光ビュー 特定のランで得たすべての露光時間の化学発光シグナルを重ね合わせ、発光シグナルのバーンアウト(基質枯渇)の兆候を検出します。

レーンコントラストツール 解析設定の一部としてレーンコントラストツールでは、ユーザーが任意に白レベルと黒レベルを設定できます。設定を保存すると、そのレーンコントラスト設定はエクスポートでき、他のアッセイやランに適用できます。

21 CFR Part 11 Compliance Compass Authorization Server 3.0は、Simple Western機器の使用で、21 CFR Part 11への準拠およびデータセキュリティ要件を満たすための支援ツールとして利用できます。

アクセス制御を有効化し、新しいAuthorization Server がインストールされている場合には、以下の機能が有効になります:

  • Compassの起動時に、ユーザーはログインを要求されます。
  • すべての操作履歴が記録されます。
  • データファイルは署名が付き暗号化され、無断変更を防止します(すべてのファイルが管理対象となります)。
  • 装置ごとにユーザーの操作履歴が保持されます。
  • 各アッセイおよびデータファイルには、署名付き変更履歴が記録されます。

 

ビデオ: Compass for SWによるデータ解析

How to Label Peaks with Protein of Interest

 

How to Adjust Baseline

 

How to Calculate a Standard Curve

How to Calculate Statistics within Compass

 

How to Export Data