肽命名和分类指南

氨基酸的符号和结构

常见氨基酸(也称“蛋白质氨基酸”或“编码氨基酸”)以三个字母的符号表示,有时也以一个字母的符号表示。非常见氨基酸也以三个字母的符号表示,有时以一个字母“X”表示。下表列出了我们的网站和文献中使用的符号和缩写。

表 1. 常见氨基酸 | 表 2. 非常见氨基酸 | 表 3. 取代基

表 1. 常见氨基酸

氨基酸三字母符号单字母符号Properties
丙氨酸AlaANon-Polar (hydrophobic)
精氨酸ArgRBasic
天冬酰胺AsnNPolar (uncharged)
天冬氨酸AspDAcidic
半胱氨酸CysCPolar (uncharged)
谷氨酰胺GlnQPolar (uncharged)
谷氨酸GluEAcidic
甘氨酸GlyGPolar (uncharged)
组氨酸HisHBasic
异亮氨酸IleINon-Polar (hydrophobic)
亮氨酸LeuLNon-Polar (hydrophobic)
赖氨酸LysKBasic
甲硫氨酸MetMNon-Polar (hydrophobic)
苯丙氨酸PheFNon-Polar (hydrophobic)
脯氨酸ProPNon-Polar (hydrophobic)
丝氨酸SerSPolar (uncharged)
苏氨酸ThrTPolar (uncharged)
色氨酸TrpWNon-Polar (hydrophobic)
酪氨酸TyrYPolar (uncharged)
缬氨酸ValVNon-Polar (hydrophobic)

表 2. 非常见氨基酸

三字母符号氨基酸
Aad2-氨基己二酸
Aanα-天冬酰胺
Abu2-氨基丁酸
Aca2-氨基癸酸
Agnα-谷氨酰胺
Aibα-氨基异丁酸
Apm2-氨基庚二酸
Appγ-氨基-β-羟基苯戊酸
Asu2-氨基辛二酸
Aze2-羧酸酰胺
Balβ-丙氨酸
Basβ-天冬氨酸
Bly3,6-二氨基己酸(β-赖氨酸)
Bua丁酸
Bux4-氨基-3-羟基丁酸
Capγ-氨基-β-羟基环己戊酸
Cha3-环己基丙氨酸
CitN5-氨基羰基鸟氨酸
Cya3-磺基丙氨酸
Dab2,4-二氨基丁酸
Dap二氨基丙酸
Dpm二氨基庚二酸
Dpr2,3-二氨基丙酸
Dsu2,7-二氨基辛二酸
EdcS-乙基硫代半胱氨酸
Gguγ-谷氨酸
Glaγ-羰基谷氨酸
Glc乙醇酸
Glp焦谷氨酸 (Pyr) (pGlu)
Har高精氨酸
Hcy高半胱氨酸
Hhs高组氨酸
Hiv2-羟基异戊酸
Hse高丝氨酸
Hva2-羟基戊酸
Hyl5-羟基赖氨酸
Hyp4-羟基脯氨酸
Iglα-氨基-2-茚乙酸
Iva异缬氨酸
Lac2-羟基丙酸(乳酸)
Maa巯基乙酸
Mba巯基丁酸
Mhp3-羟基-4-甲基脯氨酸
Mpa巯基丙酸
Nal3-萘基丙氨酸
Nle正亮氨酸
NpheN-苄基甘氨酸
Nty正酪氨酸
Nva正缬氨酸
Oaaω-氨基酸
Oic八氢吲哚-2-羧酸
Orn鸟氨酸
Pen青霉胺(3-巯基缬氨酸)
Phg2-苯甘氨酸
Pip哌啶-2-羧酸
pSer磷酸-L-丝氨酸
pThr磷酸-L-苏氨酸
pTyr磷酸-L-酪氨酸
Sar肌氨酸(N-甲基甘氨酸)
Spg1-氨基-1-环戊酸
Sta他汀(4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸)
Thi3-噻吩丙氨酸
Tic异喹啉-3-羧酸
Tle3-甲基缬氨酸
Tmlε-N-三甲基赖氨酸
Tza3-噻唑丙氨酸
Und未定义
Wilα-氨基-2,4-二氧嘧啶丙酸

表 3. 取代基

缩写取代基
Ac乙酰基
Bn苄基 (Bzl)
Bz苯甲酰基
For甲酰基
Me甲基
Myr十四酰基
Z苄氧羰基